高通量基因分型技能-KASP分型

栏目:媒体动态 发布时间:2025-01-14 15:22:55 浏览量: 1  来源:bob电竞

  ‍ 竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)是一种根据已知SNP的结尾荧光基因分型技能,可在DNA样品中对特定位点上的SNP和InDel进行精准的双等位基因检测。

  KASP反响系统中包括DNA模板、2个通用荧光探针FAM和HEX、2个通用淬灭探针、2个正向引物、1个反向引物、ROX阴性参比染料和Taq酶等。

  KASP基因分型技能能用于候选基因的精密定位,以及在育种前期代代或初选集体中快速判定挑选带着方针功用基因的个别,筛选非必要株系,减缩育种集体规划,可以大幅度下降育种本钱、进步育种功率。特此推介KASP符号的技能流程。

  引物一共是三条,两条带有荧光接头的分型上游及一条通用下流。KASP预混液中的探针一共是四条,两条荧光探针和两条淬灭探针,荧光探针与淬灭探针是互补的,且荧光探针是与特异性上游引物的接头部分序列(tag sequence)共同。

  第1轮PCR:等位基因特异引物(3结尾能配对的)就可辨认特定等位基因模板,完结等位基因辨认,反向通用引物也会结兼并完结整个PCR进程,在此阶段,荧光符号的探针仍与其互补的淬灭探针结合,而且不会发生荧光信号。

  从第2轮PCR扩增开端,产品中呈现带着通用标签序列(tag sequence)的模板,这步完结把通用标签序列引进与SNP对应的PCR产品中。随后带着荧光的探针经过与通用序列互补的DNA链结合而添加到PCR产品中,因而不再与其互补的淬灭探针结合,由此发生荧光信号,经多轮PCR增强PCR产品荧光信号。

  使用荧光信号检测仪或荧光定量PCR仪进行信号读取,并用软件收集信号和判别等位基因类型。

  KASP渠道因其具有低本钱、高通量、灵敏、精确等优势,现在现已大范围的应用于基因定位、遗传图谱构建、集体遗传研讨等多个研讨范畴。

  双绿源可以精确的经过客户需要在指定染色体区段或基因位点开发KASP符号,用于各类作物的候选基因的精密定位、分子符号辅佐育种、F1真杂种判定、种子纯度判定、意图基因检测、回交布景挑选等。此外,双绿源可根据KASP渠道检测水稻中影响首要农艺性状的重要基因的功用位点,现在已开发多个功用基因的符号,详细见下表,欢迎感兴趣的教师联络咨询。